Caracterização molecular de Enterococcus spp. resistentes à vancomicina em amostras clínicas, ambientes aquáticos e alimentos / Molecular characterization of vancomycin-resistant Enterococcus spp. in clinical samples, aquatic environments and foods

Enterococos são ubíquos no ambiente e fazem parte da microbiota do trato gastrintestinal de humanos e animais. A importância dessas bactérias tem sido associada com infecções hospitalares e resistência a múltiplas drogas, principalmente à vancomicina. O objetivo do presente estudo foi realizar a caracterização molecular de cepas de Enterococcus spp. resistentes à vancomicina (VRE) isoladas a partir de amostras coletadas de pacientes hospitalizados, água superficial de rios urbanos e carne de frango comercializada no Brasil. A presença do gene vanA foi confirmada em 20 cepas multirresitentes isoladas durante 1997-2011. Dentre os isolados VRE, 12 cepas foram identificadas como E. faecium e oito como E. faecalis. Cepas de E. faecium isoladas de amostras clínicas e águas foram classificadas como clonalmente relacionadas pelo PFGE, com perfil virulência predominante (acm+, esp+). Adicionalmente, enquanto cepas de E. faecium isoladas dos rios pertenceram aos ST203, ST412 e ST478 (previamente caracterizados como endêmicos em hospitais brasileiros), novos STs foram identificados entre as cepas de E. faecalis (ST614, ST615 e ST616) e E. faecium (ST953 e ST954) isoladas de alimentos. Sequências completas do transposon Tn1546 das cepas clínicas VREfm 320/07 (ST478) e ambiental VREfm 11 (ST412) mostraram Tn1546-like element de ~12800 pb, com um ponto de mutação no gene vanA na posição 7.698 (substituição do nucleotídeo T pelo C) e uma no gene vanX na posição 8.234 (G pelo T). Além disso, uma deleção na extremidade esquerda do Tn1546, e as sequências IS1251 e IS1216E na região intergênica vanHS e vanYX, respectivamente, também foram detectados. A este respeito, a IS1216E na região intergênica vanXY constitui um conjunto de genes previamente relatado em cepas clínicas de VREfm no Brasil, denotando uma característica regional. IS1216E tem sido associada com os genes tcrB e aadE que conferem resistência ao cobre e aminoglicosídeos, em E. faecium e Streptococcus agalactiae, respectivamente. Portanto, essa IS pode contribuir para a rápida aquisição de resistência antimicrobiana entre as espécies de cocos Gram-positivos clinicamente importantes. Os tipos de Tn1546 indistiguíveis que foram identificados no atual estudo isolados de humano e ambientes aquáticos sugerem uma comum partilha de um pool de genes de resistência à vancomicina

Enterococci are ubiquitous in the environment and in the intestinal tract of humans and animals. The importance of these bacteria has been associated with nosocomial infection and multiple resistance to antimicrobial agents, mainly vancomycin. The aim of the present study was to perform molecular characterization of vancomycin-resistant Enterococcus spp. strains (VRE) isolated from hospitalized patients, surface water of urban rivers and retail chicken meat in Brazil. The presence of the vanA gene was confirmed in 20 multidrug-resistant strains isolated in 1997-2011. Among these VRE isolates, (n = 12) were identified as E. faecium and (n = 8) as E. faecalis. E. faecium strains isolated from water and clinical samples were classified as clonally related by PFGE, the predominant virulence profile being (acm+, esp+). Additionally, while E. faecium strains isolated from rivers belonging to ST203, ST412 and ST478 (previously characterized as endemic in Brazilian hospitals), new STs were identified among strains of E. faecalis (ST614, ST615 and ST616) and E. faecium (ST953 and ST954) isolated from food. Complete sequences of transposon Tn1546 from VREfm clinical strain 320/07 (ST478) and environmental strain VREfm 11 (ST412) showed a Tn1546-like element of ~12800 bp, with T7698C vanA and G8234T vanX mutations. Moreover, deletion of the Tn1546 left extremity, and the IS1251 and IS1216E sequence inside the vanHS and vanYX intergenic region, respectively, were also detected. In this regard, the IS1216E sequence inside the vanXY intergenic region constitutes a gene array previously reported for Brazilian VREfm clinical strains alone, denoting a regional characteristic. IS1216E has been associated with tcrB and aadE genes, which confer resistance to copper and aminoglycosides, in E. faecium and Streptococcus agalactiae, respectively. Therefore, IS1216E should contribute to rapid acquisition of antimicrobial resistance among species of the clinically important Gram-positive cocci. On the other hand, Tn1546-like elements were identical among clinical and environmental VREfm isolates, suggesting sharing of a common vancomycin resistance gene pool

The effect of structural enrichment in hatchery tanks on the morphology of two neotropical fish species

Reared fish differ from wild fish in several aspects, including morphology, because they are adapted to captive conditions that are totally different from natural conditions. To minimize the influence of the hatchery environment on the morphology of fish, the use of environmental enrichment through the incorporation of natural designs in captivity, has been proposed. In the present study, we performed the physical structuring of fish farming tanks to verify the enrichment effect on the morphology of two species of neotropical fishes: Prochilodus lineatus and Brycon orbignyanus. Each species was subjected to four different treatments over two months: tanks with submersed logs, with artificial aquatic plants, with both structures and without any structure. Results showed that the structural enrichment had a strong effect on the morphology of the cultured fish, which varied with each species analyzed and with the type of structural complexity added to the tanks. There was an increase of morphological variability in the population of P. lineatus and an increase of the average length in the population of B. orbignyanus. This shows that the environmental enrichment is capable to induce morphological differentiation through phenotypic plasticity, probably generating phenotypes more adapted to exploiting a complex environment. Peixes cultivados diferem de peixes selvagens em vários aspectos, incluindo morfologia, pois são adaptados às condições de cativeiro, que são totalmente diferentes das condições naturais. Para minimizar a influência do meio de cultivo sobre a morfologia dos peixes, o enriquecimento ambiental, através da incorporação de 'designs' naturais em cativeiro, tem sido proposto. No presente estudo, foi realizada a estruturação física de tanques de piscicultura para verificar o efeito deste tipo de enriquecimento ambiental sobre a morfologia de duas espécies de peixes neotropicais: Prochilodus lineatus e Brycon orbignyanus. Cada espécie foi submetida ao longo de dois meses a quatro diferentes tratamentos: tanque com troncos submersos, tanque com plantas aquáticas artificiais, tanque com ambas as estruturas e tanque sem qualquer estrutura. Os resultados demonstraram que o enriquecimento estrutural teve forte efeito sobre a morfologia dos peixes cultivados, o que variou de acordo com a espécie analisada e com o tipo de complexidade estrutural adicionada aos tanques. Houve aumento da variabilidade morfológica na população de P. lineatus e aumento do comprimento médio na população de B. orbignyanus. Isto mostra que o enriquecimento do ambiente de cultivo é capaz de induzir a diferenciação morfológica através de plasticidade fenotípica, provavelmente gerando fenótipos mais adaptados à exploração de um ambiente complexo.

Changes in ichthyofauna composition along a gradient from clearwaters to blackwaters in coastal streams of Atlantic forest (southeastern Brazil) in relation to environmental variables

The lack of knowledge of the freshwater ichthyofauna of coastal streams in the State of São Paulo (Brazil) is a cause of concern, as these streams are inserted in the Atlantic forest, a hotspot highly threatened. The aim of the present study is to investigate the freshwater ichthyofauna composition of clear and blackwater streams in a preservation area of Brazilian Atlantic forest. Fish samples were taken using electrofishing. A total of 20 species were registered, with Astyanax ribeirae, Hollandichthys multifasciatus, and Mimagoniates microlepis (Characiformes, Characidae) as the more representative. In general, the observed pattern of occurrence and distribution of fish species varied according to habitat characteristics, due to the longitudinal gradient in clearwaters, and among clearwaters and blackwaters. In clearwater streams, the headwater stretches had lower species diversity, while the opposite occurred in the middle and lower sites. These longitudinal variations of ichthyofauna were related with habitat characteristics (depth, stream flow, and bottom type) in which they were found, since the diversity of habitats was higher in headwaters and lower in downstream reaches (middle and lower sites). The physical and chemical variables of water do not seem to have influenced the distribution of species in clearwater streams, but the clear and blackwater fish composition was influenced mainly by pH concentration. Unlike the spatial differences, significant temporal differences were not registered in fish assemblages, probably due to the absence of a pronounced dry season in the studied region.

A falta de conhecimento dos peixes de água doce em riachos costeiros no estado de São Paulo é preocupante, considerando que estes riachos estão inseridos em um bioma brasileiro extremamente ameaçado, a floresta Atlântica. O objetivo deste trabalho é investigar a composição da ictiofauna de riachos de águas claras e pretas em uma área preservada da Mata Atlântica. A pesca elétrica foi utilizada para amostrar a ictiofauna. Foram coletadas 20 espécies, sendo Astyanax ribeirae, Mimagoniates microlepis e Hollandichthys multifasciatus (Characiformes, Characidae), as mais representativas. De modo geral, o padrão de ocorrência e distribuição da ictiofauna observado variou de acordo com as características dos habitats, tanto no gradiente longitudinal nos riachos de águas claras, quanto entre os riachos de águas claras e o de águas pretas. Nos riachos de águas claras, os trechos de cabeceiras apresentaram riqueza e diversidade de espécies menor, enquanto o inverso ocorreu nos pontos médios e inferiores. Estas variações longitudinais da ictiofauna provavelmente estão associadas às características dos ambientes (profundidade, correnteza e substrato) em que foram encontradas, visto que a diversidade de habitats foi maior nos trechos de cabeceiras e menor nos trechos médios e inferiores. As variáveis físicas e químicas da água parecem não ter influenciado tanto a distribuição das espécies nos riachos de águas claras, porém as diferenças na composição da ictiofauna entre riachos de águas claras e de águas pretas foram influenciadas principalmente pelo pH. Ao contrário das diferenças espaciais, não foram registradas diferenças temporais nas ictiocenoses, provavelmente devido à ausência de um período seco pronunciado na região de estudo.

Prevalencia de exótosis entre surfistas de la costa guipuzcoana / Prevalence of exostoses surfers of the Basque coast

Las exóstosis de Conducto Auditivo Externo (CAE) son formaciones óseas benignas muy frecuentes entre los practicantes de deportes acuáticos. El objetivo del presente trabajo es observar la prevalencia de exóstosis entre surfistas de la costa guipuzcoana y estudiar la correlación existente entre el tiempo dedicado al deporte y la prevalencia severidad de las exóstosis. Para ello se ha realizado un estudio transversal y se ha entregado un cuestionario a 41 surfistas a los que luego se ha realizado un examen otoscópico. De los 41 surfistas 25 tenían exóstosis (61%) y la prevalencia era significativamente mayor (p<0,05) en aquéllos que llevaban practicando el deporte más de10 años que los que llevaban menos de 10 años. La severidad también era mayor entre los del primer grupo (p < 0,05). Las horas dedicadas al deporte también han mostrado resultados similares. Sólo 1 de los 25 (4%) casos ha requerido una intervención quirúrgica (AU)

Exostoses of the External Auditory Canal are benign bony tumours very common in individuals who frequently practice water activities. The objective [corrected] of this study is to determine the prevalence of exostoses in a population of surfers of the Basque Coast. We have studied the correlation between years surfing and the prevalence and severity of exostoses. We have done a cross-sectional epidemiological study giving a questionnaire Twenty-five of the 41 surfers had surfer's ear (61%) and the prevalence was significantly higher in those who had surfed for more than 10 years (p < 0.05). Severity was also higher in the first group (p < 0.05). The relation between the hours dedicated to the sport showed similar results. only one of the 24 cases needed surgery (4%) (AU)